■ CONTENTS (update)
・
Protein
: タンパク質関連の研究.(02.11.28)
・
SA
: Simulated Annealingの研究.(02.10.20)
・
Society
: 私が参加する学会関連.(02.06.26)
・
Literature
: 研究において調査した文献.(02.08.21)
[Research top]
[Protein group]
■ Protein
○ 適合度と温度の関係(02.11.28)(
ISDL 20020409022
)
適合度と温度の関係を検証し,重要温度領域で高い適合度が得られるか検証した.
○ 逐次SAにPSA/AT(GA)の導入(02.11.22)(
ISDL 20020409021
)
逐次SAを行った後にPSA/AT(GA)を行う手法を提案し,数値実験を通して本手法を検証した.
○ PSA/AT(GA)における個体数とMCsweep数の検証(02.11.20)(
ISDL 20020409020
)
PSA/AT(GA)の個体数を変化させ,解探索能力を比較した.
○ PSA/AT(GA)におけるGAオペレータの順序(02.11.15)(
ISDL 20020409019
)
PSA/AT(GA)のGAオペレータ適用順序を選択→突然変異→交叉として,温度推移と解探索能力を検証した.
○ PSA/AT(GA)における突然変異の影響(02.11.13)(
ISDL 20020409017
)
PSA/AT(GA)における突然変異率を変化させて,解探索能力の比較を行った.
○ PSA/AT(GA)における交叉の影響(02.11.7)(
ISDL 20020409017
)
PSA/AT(GA)における交叉率を変化させて,解探索能力の比較を行った.
○ PSA/AT(GA)の(Ala)10への適用(02.11.5)(
ISDL 20020409016
)
(Ala)10にPSA/AT(GA)を適用し,有効性を検証した.
○ PSA/AT(GA)のMet-enkephalinへの適用(02.10.25)(
ISDL 20020409015
)
Met-enkephalinにPSA/AT(GA)を適用し,有効性を検証した.
○ 並列SAのタンパク質への適用(02.10.25)
ISDL 20020409014
)
Met-enkephalin,(Ala)10に並列SAを適用し,解交換の有効性を検証した.
○ Met-enkephalinにおける重要温度領域(02.09.25)
ISDL 20020409010
)
Met-enkephalinにおける重要温度領域を検証した
○ タンパク質における重要温度領域について(02.07.03)
Met-enkephalinにおける重要温度領域について調査
○ タンパク質に逐次SAを適用(2) (02.09.18)
ISDL 20020409009
)
3つのタンパク質に逐次SAを適用し,性能検証
○ タンパク質に逐次SAを適用(1) (02.09.11
ISDL 20020409008
)
2つのタンパク質に逐次SAを適用し,性能検証
○ タンパク質に逐次SAを適用(02.07.03)
5つのタンパク質に対して逐次SAを適用し,解の動きを検証
○ タンパク質に逐次SAを適用(02.06.26)
Met-enkephalinに逐次SAを適用した.
■ SA (Simulated Annealing)
○ TSPにおける重要温度領域(02.10.20)
ISDL 20020409013
(new)
8つのTSPに一定温度のSAを適用し,重要温度領域の確認を行った.
○ PSA/AT(GA),逐次SA,TPSAの性能比較(02.10.16)
ISDL 20020409012
PSA/AT(GA),逐次SA,TPSAを4つのパラメータを用いて性能比較を行った.
○ PSA/AT(GA)の性能検証(02.10.16)
ISDL 20020409011
PSA/AT(GA)の説明と数値実験
○ 適応的TPSAについて(02.08.21)
適応的TPSAのアルゴリズムの説明
○ TPSAの検証(02.08.21)
TPSAと適応的TPSAの検証を行った.
○ PSA/ATのパラメータ検討(2)(02.06.12)
PSA/ATのパラメータを変更し,追加実験を行った
○ PSA/ATのパラメータ検討(1)(02.06.05)
PSA/ATのパラメータを変更し,追加実験を行った
■ Society
○ GECCOの準備(02.06.26)
7/9に参加するGECCOの報告内容
○ SMCチュニジアの論文作成(02.06.26)
IEEE SMC2002に提出する論文について
■ Literature
○ Prediction of Low-Energy Structure of Met-Enkephalin by Monte Carlo Simulated Annealing(02.08.21)
(new)
○ モンテカルロシミュレーションによるタンパク質の立体構造予測(02.06.26)
○ 分子生物情報学の現状と動向(02.06.19)
○ Genetic algorithms for protein structure prediction(02.06.19)
○ Implementation models for distributed memory architecture of parallel simulated annealing usign genetic crossover(02.06.12)